Em fevereiro de 1999, uma série de assassinatos coloca Shiki Ryougi e Mikiya Kokutou no limite. Esses crimes compartilham uma semelhança perturbadora com um conjunto semelhante de homicídios desde 1995, quando Shiki e Mikiya se conheceram, e despertam um desejo sombrio e assassino que permanece adormecido na alma de Shiki desde então. Com Shiki sob suspeita devido ao seu envolvimento nos assassinatos passados e suposta semelhança com o assassino, ela e Mikiya decidiram encontrar o verdadeiro agressor. No meio de suas investigações separadas, Mikiya cresce cada vez mais preocupada com o bem-estar de Shiki e corre para encontrar o responsável, a fim de proteger Shiki de seus próprios impulsos. Com a liderança que ele recebe de seu primo, investigador da polícia Daisuke Akimi, Mikiya é levada ao ventre de Mifune City, pois a salvação da alma de Shiki está em sua determinação de provar sua inocência de uma vez por todas.