Em uma noite solene em julho de 1998, o adolescente Fujino Asagami é violado sem piedade por uma gangue de rua em um bar em ruínas. Não importa que abuso físico ou sexual eles causem, no entanto, a menina considera seus captores com a mesma expressão apática. No dia seguinte, corpos mutilados são descobertos no mesmo prédio, tão dilacerados que os investigadores acham inviável até mesmo considerar o culpado humano. Em outros lugares, um pedido do cliente chega à agência de detetives de Touko Aozaki, encarregando Shiki Ryougi de capturar ou matar o autor do incidente da noite passada. Mas logo se espalhou a notícia de que um único sobrevivente escapou do massacre e agora o assassino está lavando tudo em seu caminho para localizá-lo e exterminá-lo. Uma brutal corrida contra o tempo começa, colocando Shiki contra um inimigo perigoso, imperceptível até aos seus olhos lendários.