Em uma era onde os humanos habitam as estrelas, o entretenimento e os grupos de ídolos foram banidos em vários cantos da galáxia. Entretanto, um grupo cheio de luz e desejos puros, o AKB0048, possui a nobre vontade de continuar a iluminar e alegrar o coração das pessoas com a música, como suas sucessoras faziam quando a Terra ainda existia. Porém, por ser considerada uma forma de extraviar e influenciar a mente humana, a música passou a ser vista como uma ameaça, por isso, esse grupo precisa enfrentar o governo e diversos perigos em planetas onde o entretenimento é proibido, para poder levar felicidade ao coração das pessoas. Nagisa, Yuuka, Orine e Chieri, após presenciarem um concerto do grupo, passam a ter o desejo de ingressar nele e levar essa alegria pras pessoas. É aí que a história da 77ª geração de aprendizes do AKB0048 começa!