Em Suimei High, o dormitório Sakura-sou é famoso por abrigar os delinquentes mais notórios da escola. Assim, quando a relativamente mansa Sorata Kanda é transferida para o dormitório, escapar desse manicômio torna-se seu principal objetivo. Preso lá por enquanto, ele deve aprender a lidar com seus colegas residentes, incluindo o animador borbulhante Misaki Kamiigusa, o charmoso escritor playboy Jin Mitaka e o sempre recluso Ryuunosuke Akasaka. Cercado de estranheza, Sorata frequentemente encontra descanso em suas interações com sua única amiga "normal", a aspirante a dubladora Nanami Aoyama. Quando Mashiro Shiina – um novo intercambista – se junta ao dormitório, Sorata fica instantaneamente encantada com sua beleza. Por baixo de sua aparência sobrenatural, Mashiro é uma savant autista, capaz de brilhantismo mundialmente conhecido em sua arte, mas incapaz de realizar tarefas diárias simples. Depois que Sorata acaba encarregada de cuidar de Mashiro, os dois inevitavelmente se aproximam, com o desejo inicial de Sorata de escapar do dormitório se tornando um objetivo esquecido. Apesar de suas excentricidades, cada residente é incrível em seu próprio campo, deixando Sorata para lidar com sua própria falta de qualquer habilidade em particular. Com brilhantismo ao seu redor, ele se esforça para se tornar um igual ao seu talento. Girando em torno das dificuldades e alegrias de seu elenco colorido, Sakura-sou no Pet na Kanojo é um emocionante conto de amadurecimento de amizade, amor, ambição e desgosto – através das lentes de uma pessoa comum cercada pelo extraordinário.