Em uma vila movimentada de espíritos, Yuzu, uma alegre raposa, começa seu primeiro emprego como atendente na tradicional pousada de águas termais Konohanatei. Embora Yuzu não tenha experiência em trabalhar em um estabelecimento de alta classe, Kiri, a afável e confiável atendente principal, imediatamente a coloca para trabalhar aprendendo o básico. Embora a ânsia de Yuzu inicialmente prove ser mais um obstáculo do que uma bênção, sua natureza brincalhona traz um charme único para a pousada, já que tanto os clientes quanto seus colegas de trabalho rapidamente se aquecem para seus erros desajeitados, mas bem-intencionados. Sob a orientação das outras raposas – a rígida Satsuki, a despreocupada Natsume, a crítica Ren e a pacata Sakura – Yuzu aprende constantemente o ofício de uma atendente de pousada enquanto aprende a amar o mundo mágico ao seu redor. Konohana Kitan apresenta a emocionante história de uma simples raposa que cria laços com outras pessoas e encontra um lar em meio ao misterioso e belo mundo dos espíritos.