Escola de Fuka (Fuka Gakuen) é uma escola onde há rumores de estranhos monstros, os orphan, e as únicas pessoas capazes de cuidar deles são meninas com poderes especiais chamadas HiME (Highly-advanced Materializing Equipment) que conseguem materializar vários tipos de armas diferentes para enfrentar estes monstros. Além disso as Himes também conseguem invocar unidades de batalha em forma de animais. Mai é uma estudante recém chegada a escola, ela e seu irmão vem com esperanças de uma nova vida, quando é atacada por monstros, e acaba descobrindo seus poderes de Hime. Então ela e suas novas amigas tem o dever de manter seus poderes em sigilo e de proteger a escola.