Com a descoberta dos portais, chamados de "Inflation Hole", em AD 2300, viagens interestelares tornaram-se realidade, sendo possível ir de um sistema solar a outro em pouco tempo. Entretanto, tal tecnologia também proporcionou facilidades para invasores de outros universos, chamados de "fantasmas", eles pretendem invadir nosso sistema através dos portais. Eles acabam invadindo uma estação de vigilância conhecida como "Watcher's Nest", onde quatro garotas estavam finalizando seu treinamento. Entre elas, Kureha Misaki, uma novata da Organização Especial Ops - chamada de Seraphim.