No futuro próximo, uma série de cataclismas climáticos acabaram gerando um eterno super ciclone no centro do Pacífico Ocidental: é o chamado "Grand Roar", que causou grandes danos ao mundo, inundando países inteiros. Devido à grande importância do comércio entre os países, a navegação tornou-se um ponto importante no mundo, e com ela, surgiram piratas e organizações que tentam controlar as linhas marítimas. Para proteger os mercantes e navios de passageiros, o exército teve que aceitar a presença de navios civis armados como escolta. Um testes navios é o "Pascal Magi", um navio só de mulheres, e por isto apelidado de "Alice Brand". Quando Hyousuke Nagimiya, um engenheiro de sistemas é enviado para fazer upgrades nos sistemas do Pascal Magi, ele não esperava que sua irmã mais velha fosse a capitã.